在龙国S市，云鹤坐在游戏仓，即将开启主神游戏的征程。这款十年前降临的游戏，关乎世界安危，每人成年后会被强制传送，或通过游戏舱提前进入，玩家每年需在其中度过三个月，已连续失败两个，如今《废土世界》开服，而这也是人类最后的希望。
上一世，云鹤觉醒S级召唤天赋，加入公会却被压榨，最终人类失败，世界末日降临，他也丧生其中。重生回开服前夕，进入游戏时因灵魂穿越携带记忆，触发系统异常。面对主神系统给出的方案，他选择升级旧号天赋，成功觉醒SSS级天赋“造物主”，能召唤可分裂且继承自身属性技能的变异体。
进入废土世界，云鹤凭借逆天天赋，在荒山一路收集物资、击杀变异体，快速升级，身边的变异体大军不断壮大。途中，他在避难所偶遇现实中楼上的姐妹花秦瑶和秦洛，展示了自己的强大实力。面对秦洛拉拢他加入洛水公会，云鹤因上一世被公会伤害而拒绝。
为搭建庇护所，云鹤带领变异体大军前往沙漠绿洲的军事基地。这里虽有大量资源，但也潜藏危险，他先后遭遇一阶变异体蝎人和暴徒。在变异体大军的围剿下，成功将其击杀，最终在开服第二天就搭建出第一个庇护所，震惊全服。此后，云鹤将如何利用庇护所发展势力？又将如何改写人类在主神游戏中的命运。